MRI另一重要意义在于它能准确发现和定位肛瘘的支管和残余脓腔。支管和残腔在T2加权和STIR序列中表现为原发主管周边存在的高信号结构，静脉应用对照剂会导致局部信号增强。最常见的支管形态是经括约肌肛瘘，主管穿过外括约肌进入肛管，支管进入坐骨直肠窝顶端。MRI对提肛肌上方的支管更加重要，这些支管不仅难以发现，处理也极为困难。对于复发性肛瘘和克罗恩肛瘘而言，运用MRI诊断复杂性的支管和残留脓腔就更为重要。

在临床实践中，我们应用三腔两囊管进行改造，去除胃囊，留食管囊，远端结扎（图3-8），经导管食管囊内注入80～100ml生理盐水，从而通过水囊的扩张来扩张直肠中下段。采用siemens avanto 1.5T超导型磁共振扫描仪扫描，相控阵列线圈（phased-array coli），层厚4cm，无间隔，分别做横截位、矢状位（部分患者加冠状位扫描），其中T1加权像应用自回旋波序列，T2加权像应用短时翻转恢复序列，T2加权像并进行压脂。检查时直肠腔内放置自制改良后的三腔管，取仰卧位进行扫描，轴位切片与肛管垂直，冠状位和矢状位切片与肛管直肠轴线平行。影像学分析包括肛瘘内口、主管及存在支管和脓腔。28例患者应用改良三腔管成功插管，肛管直肠扩张充分，扫描获得图像良好，其中25例诊断为复杂性肛瘘进行手术治疗，1例诊断为骶前囊肿行经骶尾部骶前囊肿切除术，2例诊断为直肠周围占位性病变，局部活检为黏液腺癌。28例患者磁共振诊断结果与手术后诊断结果均一致。25例肛瘘患者中，术前指诊确定主管的准确率为76%，磁共振检查确定了全部的肛瘘主管，且与手术结果一致。术前指诊支管的准确率为57.9%，磁共振检查确定支管或脓腔准确率为94.7%。与麻醉下探查比较，术前指诊时确定了内口的准确率为48%，磁共振检查确定内口的准确率为84%。本研究结果证实了磁共振对复杂性瘘管的术前Park分类与手术结果一致，为手术提供了理想的解剖学依据，证实磁共振对肛瘘内口诊断的准确率和对主管、支管和脓腔的准确率明显优于术前直肠指诊的检出率。与Holzer等报道磁共振体线圈检测内口的准确率为75%比较，提示在直肠腔内放置水囊有助于提高对内口的诊断。